Drodzy użytkownicy! Wszystkie materiały dostępne na stronie zostały przetłumaczone z innych języków. Chcemy przeprosić za jakość tekstów, mamy jednak nadzieję, że będą one przydatne. Pozdrawiamy, Administracja. E-mail: admin@plmedbook.com

W jaki sposób pojedyncze badanie krwi może zidentyfikować całą historię infekcji wirusowej

Naukowcy stworzyli to, co mówią, że jest to „pojedynczy punkt kontaktowy” do diagnozowania infekcji – test, który może określić pełną historię wirusową danej osoby przez skanowanie pojedynczej kropli krwi.

Badanie krwi

Test, nazwany VirScan, został stworzony przez Stephena Elledge’a i kolegów z Howard Hughes Medical Institute (HHMI).

„Opracowaliśmy metodologię przesiewową, aby zasadniczo spojrzeć wstecz w ludzkie serie i zobaczyć, jakie wirusy doświadczyły” – wyjaśnia Elledge. „Zamiast testowania pojedynczego wirusa na raz, co wymaga dużego nakładu pracy, możemy przetestować wszystkie te naraz. To jednorazowe zakupy”.

Zespół wyjaśnia, w jaki sposób VirScan działa w nowym badaniu opublikowanym w czasopiśmie, w którym również ujawnia, w jaki sposób test został przeprowadzony podczas testów na próbkach krwi ponad 500 uczestników zakażonych niektórymi wirusami.

Elledge i jego koledzy zsyntetyzowali ponad 93 000 krótkich odcinków DNA, aby stworzyć test, przy czym każda sekcja koduje różne fragmenty wirusowych białek, zwane peptydami.

Następnie zespół wprowadził sekcje DNA do bakteriofagów – wirusów, które atakują komórki bakteryjne i infekują je. Każdy bakteriofag formowany peptydem, z peptydem wyświetlanym na powierzchni bakteriofaga.

Razem bakteriofagi pokazują wszystkie sekwencje białkowe obecne w ponad 1000 szczepów znanych obecnie ludzkich wirusów.

Wyjaśniając, w jaki sposób wirus VirScan identyfikuje wirusy w próbkach krwi, naukowcy zauważają, że przeciwciała przeciwwirusowe obecne we krwi rozpoznają unikalne cechy znane jako epitopy, które znajdują się w peptydach na powierzchni każdego bakteriofaga. Gdy bakteriofagi łączą się z próbką krwi, przeciwciała we krwi identyfikują i wiążą się z tymi epitopami.

Naukowcy zbierają następnie te przeciwciała i pozbywają się wszystkiego oprócz bakteriofagów, do których są przywiązani.

Poprzez przeprowadzanie sekwencjonowania DNA na tych bakteriofagach, zespół jest w stanie zidentyfikować peptydy, do których przylgnęły przeciwciała, ujawniając, które wirusy wcześniej przeszedł system odpornościowy osobnika, czy to przez zakażenie, czy szczepienie.

Prawdopodobnie dla VirScan zajmie to około 2-3 dni, aby przeanalizować 100 próbek krwi, według Elledge’a, choć jest przekonany, że ten czas przetwarzania może zostać zwiększony, tym bardziej test jest rozwijany. Koszt analizowania jednej próbki krwi wynosiłby około 25 USD.

Test wykazał wysoką czułość i swoistość

Naukowcy przetestowali VirScan na próbkach krwi 569 osób ze Stanów Zjednoczonych, Afryki Południowej, Tajlandii i Peru, o których wiadomo, że zostały zakażone niektórymi wirusami, w tym ludzkim wirusem niedoboru odporności (HIV) i wirusem zapalenia wątroby typu C.

Ogólnie rzecz biorąc, VirScan przeanalizował około 100 milionów możliwych interakcji między przeciwciałami i epitopami z próbek krwi, przy czym test zapewnia bardzo dokładne wyniki, według zespołu. Elledge mówi:

„Byliśmy w zakresie czułości 95-100% dla [HIV i wirusowego zapalenia wątroby typu C], a specyfika była dobra – nie identyfikowaliśmy fałszywie osób, które były negatywne, co dawało nam pewność, że możemy wykryć inne wirusy, a kiedy widzieliśmy je, abyśmy wiedzieli, że są prawdziwe. „

Zespół odkrył, że każda osoba biorąca udział w badaniu miała średnio 10 różnych wirusów, a ludzie w Afryce Południowej, Peru i Tajlandii posiadali przeciwciała przeciwko większej liczbie wirusów niż te w Stanach Zjednoczonych.

Ponadto odkryli, że dorośli posiadali przeciwciała przeciwko większej liczbie wirusów niż dzieci, a osoby z HIV miały przeciwciała przeciwko większej liczbie wirusów niż te bez HIV.

Być może najbardziej zaskakującym odkryciem było to, że odpowiedzi przeciwciał przeciwko niektórym wirusom były podobne u każdego osobnika; przeciwciała różnych osób rozpoznały dokładnie te same aminokwasy obecne w peptydach określonych wirusów.

Naukowcy są przekonani, że VirScan może być skuteczną alternatywą dla istniejących metod testowania wirusów, które testują poszczególne wirusy jeden po drugim.

Jako że test może określić historię wirusów danej osoby, zespół wierzy, że oferuje ona możliwość odkrycia czynników wpływających na zdrowie, które mogły zostać przeoczone. Test zapewnia również możliwość oceny i porównania infekcji wirusowych w dużych populacjach, a może nawet mieć wpływ na projektowanie szczepionek.

Ich badania, jak twierdzą naukowcy, pomogły im poprawić dokładność VirScan i mają nadzieję, że poprawi się dalej dzięki większej ilości badań.

Podejście zastosowane do stworzenia VirScan może być również zastosowane do identyfikacji innych przeciwciał, notatek zespołu, takich jak te zaangażowane w choroby autoimmunologiczne, w których układ odpornościowy atakuje zdrowe tkanki organizmu.

Like this post? Please share to your friends: